Sistem penjaminan mutu di program studi S1, S2 dan S3 dibangun berdasarkan kebijakan penjaminan mutu di tingkat Universitas. Pusat Jaminan Mutu (PJM) UB membangun sistem penjaminan mutu khas model Universitas Brawijaya yang pada tahun 2006-2009 disebut Sistem Penjaminan Mutu Akademik (SPMA). Sistem ini standar mutunya berdasarkan gabungan sistem Program Hibah Kompetisi (PHK) dari Dikti. Sejalan dengan pengalaman implementasi siklus penjaminan mutu di lungkungan UB, maka mulai tahun 2010 sampai dengan sekarang sistem penjaminan mutu UB disebut Sistem Penjaminan Mutu Internal (SPMI). Sistem ini menggabungkan model Sistem Menejemen Mutu ISO 9001:2008, Dikti, PHK dan BAN-PT, dengan tujuan agar sistem ini bisa secara fleksibel diimplementasikan dalam berbagai keperluan, sehingga sistem ini efisien dan efektif. Sistem ini dapat digunakan dalam penjaminan mutu internal maupun eksternal (sertifikasi ISO dan akreditasi nasional mapun internasional).
SPMI UB dimulai dari:
- organisasi penjaminan mutu di Universitas, Fakultas/Program/ Program Pasca Sarjana dan Jurusan/Program Studi,
- Sistem dokumen dan
- Audit.
