Program Pascasarjana Universitas Brawijaya (PPSUB) dirintis sejak tahun 1981. Rintisan ini diawali dengan kerjasama antara Universitas Brawijaya dengan Universitas Gadjah Mada untuk menyelenggarakan Program Kegiatan Pengumpulan Kredit (KPK) UGM – UNIBRAW. Program ini bertujuan untuk membantu Universitas Brawijaya dalam merencanakan dan melaksanakan pendidikan pascasarjana secara mandiri.
Dengan semakin berkembangnya program studi sarjana di lingkungan Universitas Brawijaya, dan semakin banyaknya peminat yang menginginkan dibukanya program studi baru, mulai tahun akademik 1995/1996 Program Pascasarjana Universitas Brawijaya membuka tujuh program studi S2, yaitu : (1). Program Studi Teknologi Pasca Panen, (2). Program Studi Ilmu Ternak, (3). Program Studi Manajemen, (4). Program Studi Ilmu Administrasi, (5). Program Studi Biomedik, (6). Program Studi Biologi Reproduksi, (7). Program Studi Teknik Sumberdaya Air.
Mulai tahun 1998 Program Pascasarjana Universitas Brawijaya menyelenggarakan program studi S2 untuk Teknik Sipil dengan SK Dirjen Dikti no. 52/DIKTI/KEP/1998 tanggal 23 Pebruari 1998 dan pada tahun 2001 untuk Teknik Mesin dengan SK Dirjen Dikti no. 91/DIKTI/KEP/2001. Kemudian pada tahun 2007 dibuka program magister untuk Teknik Elektro dengan SK Dikti no. 1575/D/T/2007 tanggal 29 juni 2007 dan diikuti oleh program studi lain termasuk program Doktor selengkapnya disajikan dalam Tabel 1.
Berdasarkan SK Rektor No. 030/SK/2006 tentang Penyelenggaraan Program Pascasarjana UB, maka mulai tahun ajaran 2009/2010 seluruh program studi ilmu-ilmu keteknikan dikelola oleh Fakultas Teknik UB.
Dengan demikian terjadi perubahan nama dari Program Pascasarjana Universitas Brawijaya (PPSUB) menjadi Program Magister dan Doktor Fakultas Teknik Universitas Brawijaya (PMD FTUB). Mulai tahun ajaran 2013/2014 PMD FTUB masuk di bawah naungan jurusan yang berkaitan.
Program Magister Teknik Sipil Universitas Brawijaya (PMTS-UB) selanjutnya membuka beberapa konsentrasi keahlian berikut:
1998: Minat Teknik Sumberdaya Air
1999: Minat Transportasi
2000: Minat Struktur
2003: Minat Perencanaan Wilayah & Kota
2004: Minat Manajemen Konstruksi Arsitektur Lingkungan Binaan
2008: Double Degree Program
2009: International Class
Namun seiring dengan perkembangan sistem pengelolaan program studi di Fakultas Teknik Universitas Brawijaya, Program Magister Teknik Sumberdaya Air selanjutnya berada di bawah pengelolaan Jurusan Teknik Pengairan. Sedangkan Minat Arsitektur Lingkungan Binaan Selanjutnya di bawah pengelolaan Jurusan Arsitektur.
Pengelolaan PMTS-UB juga mengalami beberapa perubahan. Pada awal berdirinya PMTS-UB berada di bawah naungan Program Pascasarjana Universitas Brawijaya. Selanjutnya tahun 2005 dialihkan di bawah pengelolaan Fakultas Teknik Universitas Brawijaya, dan pada Agustus 2013 dialihkan di bawah pengelolaan Jurusan Teknik Sipil.
Banyak alumni PMTS-UB yang telah berkiprah dalam berbagai bidang pekerjaan baik di dalam maupun luar negeri. Pengakuan eksistensi PMTS-UB diperkuat dengan keluarnya Akreditasi “A” dari Badan Akreditasi Perguruan Tinggi (BAN-PT) berdasarkan SK No. 238/SK/BAN-PT/Ak-XI/M/XI/2013 tanggal 22 November 2013. Kemudian pada tahun 2022, berdasarkan SK No.13511/SK/BAN-PT/AK-ISK/M/V/2022 maka peringkat akreditasi PMTS-UB menjadi “unggul”.